زهرا اسماعیلی، روز ۱۸ دی ۱۴۰۴ در شیراز کشته شد. به گواهی شاهد عینی (دختر او، پریسا)، نیروهای موتورسوار در حالی که شعار «حیدر، حیدر» می‌دادند، ابتدا بدن او را با گلوله‌های ساچمه‌ای نشانه گرفتند و سپس به سرش شلیک کردند. دخترش زهرا را روی پاهایش گذاشت و او آخرین کلامش را گفت: «پریسا...» قبل از اینکه جانش را از دست بدهد.